Структуру органов местного самоуправления составляют Кежемский окружной Совет депутатов, Глава Кежемского муниципального округа, Администрация Кежемского муниципального округа, Контрольно-счетный орган Кежемского муниципального округа.
Кежемский окружной Совет депутатов - представительный орган местного самоуправления, обладающий правами представлять интересы населения и принимать от его имени решения, действующие на территории округа. Совет депутатов состоит из 30 депутатов, избираемых на муниципальных выборах на основе всеобщего равного и прямого избирательного права при тайном голосовании по пропорционально-мажоритарной избирательной системе, при которой 12 депутатов избираются по единому избирательному округу пропорционально числу голосов избирателей, поданных за общетерриториальные списки кандидатов в депутаты, выдвинутые избирательными объединениями, а 18 депутатов - по одномандатным избирательным округам в соответствии с федеральными и краевыми законами сроком на 5 лет.;
Глава Кежемского муниципального округа - является высшим должностным лицом округа и наделяется собственными полномочиями по решению вопросов непосредственного обеспечения жизнедеятельности населения.
Администрация Кежемского муниципального округа является исполнительно-распорядительным органом местного самоуправления, обладающим правами юридического лица.
Контрольно-счетный орган Кежемского муниципального округа является постоянно действующим органом внешнего муниципального финансового контроля, образуется Советом депутатов округа и подотчетен ему.
